Tác dụng phụ của thuốc thường thấy: trễ kinh, có thể gặp xuất huyết, nôn,buồn nôn, tiêu chảy, đau bụng dưới, mệt, nhức đầu, chóng mặt, căng ngực…, nhưng chưa thấy ghi nhận thuốc có khả năng gây vô sinh.
Tuy nhiên thuốc không có tác dụng thay thế biện pháp tránh thai thường xuyên, thuốc được đào thải ra khỏi cơ thể sau khi uống vài ngày, nên nếu tiếp tục giao hợp không an toàn sẽ làm tăng nguy cơ có thai ngoài ý muốn.
Lưu ý: Không dùng quá 2 lần thuốc mifestad trong 1 tháng